Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CCDC173Q0VFZ6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms