Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SRSF4Q08170 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SRSF4Q08170 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms