Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SOS1Q07889 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOS1Q07889 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOS1Q07889 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOS1Q07889 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOS1Q07889 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOS1Q07889 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SOS1Q07889 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SOS1Q07889 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOS1Q07889 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SOS1Q07889 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms