Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PRKCDQ05655 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRKCDQ05655 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms