Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP7AQ04656 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms