Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APBA1Q02410 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
APBA1Q02410 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
APBA1Q02410 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
APBA1Q02410 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
APBA1Q02410 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
APBA1Q02410 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
APBA1Q02410 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
APBA1Q02410 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
APBA1Q02410 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APBA1Q02410 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APBA1Q02410 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APBA1Q02410 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APBA1Q02410 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APBA1Q02410 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APBA1Q02410 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APBA1Q02410 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APBA1Q02410 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APBA1Q02410 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APBA1Q02410 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms