Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms