Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XPCQ01831 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XPCQ01831 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XPCQ01831 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPCQ01831 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPCQ01831 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPCQ01831 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPCQ01831 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPCQ01831 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPCQ01831 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPCQ01831 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPCQ01831 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPCQ01831 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPCQ01831 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPCQ01831 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPCQ01831 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPCQ01831 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPCQ01831 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPCQ01831 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
XPCQ01831 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPCQ01831 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPCQ01831 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPCQ01831 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPCQ01831 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPCQ01831 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPCQ01831 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPCQ01831 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPCQ01831 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPCQ01831 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPCQ01831 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPCQ01831 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPCQ01831 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPCQ01831 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPCQ01831 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XPCQ01831 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XPCQ01831 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XPCQ01831 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XPCQ01831 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XPCQ01831 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XPCQ01831 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XPCQ01831 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XPCQ01831 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
XPCQ01831 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XPCQ01831 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XPCQ01831 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
XPCQ01831 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XPCQ01831 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XPCQ01831 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XPCQ01831 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XPCQ01831 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XPCQ01831 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XPCQ01831 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XPCQ01831 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XPCQ01831 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XPCQ01831 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPCQ01831 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPCQ01831 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPCQ01831 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPCQ01831 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPCQ01831 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPCQ01831 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPCQ01831 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPCQ01831 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPCQ01831 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPCQ01831 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPCQ01831 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPCQ01831 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPCQ01831 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPCQ01831 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPCQ01831 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPCQ01831 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPCQ01831 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPCQ01831 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPCQ01831 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
XPCQ01831 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPCQ01831 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPCQ01831 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
XPCQ01831 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPCQ01831 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPCQ01831 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPCQ01831 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
XPCQ01831 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
XPCQ01831 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
XPCQ01831 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
XPCQ01831 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
XPCQ01831 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
XPCQ01831 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
XPCQ01831 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
XPCQ01831 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
XPCQ01831 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
XPCQ01831 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
XPCQ01831 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
XPCQ01831 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
XPCQ01831 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
XPCQ01831 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
XPCQ01831 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
XPCQ01831 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
XPCQ01831 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
XPCQ01831 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
XPCQ01831 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms