Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HERVK_113P63132 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms