Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 ADNP-203ENST00000396029 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 MTMR3-202ENST00000333027 8906 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TMEM258P61165 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms