Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLTPP55058 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLTPP55058 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLTPP55058 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLTPP55058 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLTPP55058 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLTPP55058 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLTPP55058 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLTPP55058 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PLTPP55058 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLTPP55058 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLTPP55058 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLTPP55058 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLTPP55058 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLTPP55058 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLTPP55058 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLTPP55058 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLTPP55058 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLTPP55058 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLTPP55058 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLTPP55058 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLTPP55058 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLTPP55058 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLTPP55058 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLTPP55058 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLTPP55058 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLTPP55058 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLTPP55058 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLTPP55058 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PLTPP55058 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLTPP55058 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLTPP55058 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLTPP55058 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLTPP55058 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLTPP55058 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLTPP55058 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLTPP55058 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLTPP55058 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PLTPP55058 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLTPP55058 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLTPP55058 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLTPP55058 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLTPP55058 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLTPP55058 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLTPP55058 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLTPP55058 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLTPP55058 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLTPP55058 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLTPP55058 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLTPP55058 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLTPP55058 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLTPP55058 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PLTPP55058 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLTPP55058 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLTPP55058 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLTPP55058 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PLTPP55058 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLTPP55058 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLTPP55058 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLTPP55058 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLTPP55058 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLTPP55058 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLTPP55058 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLTPP55058 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PLTPP55058 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLTPP55058 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLTPP55058 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLTPP55058 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLTPP55058 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PLTPP55058 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLTPP55058 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLTPP55058 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLTPP55058 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLTPP55058 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLTPP55058 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLTPP55058 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLTPP55058 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLTPP55058 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLTPP55058 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLTPP55058 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLTPP55058 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLTPP55058 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLTPP55058 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLTPP55058 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLTPP55058 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLTPP55058 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLTPP55058 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLTPP55058 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLTPP55058 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLTPP55058 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLTPP55058 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLTPP55058 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLTPP55058 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLTPP55058 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLTPP55058 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLTPP55058 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLTPP55058 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLTPP55058 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLTPP55058 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PLTPP55058 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms