Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNA3P52797 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms