Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIK1P39086 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms