Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FDFT1P37268 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FDFT1P37268 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms