Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD13P35453 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms