Protein–RNA interactions for Protein: P30040

ERP29, Endoplasmic reticulum resident protein 29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP29P30040 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERP29P30040 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERP29P30040 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ERP29P30040 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERP29P30040 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ERP29P30040 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERP29P30040 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ERP29P30040 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ERP29P30040 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERP29P30040 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERP29P30040 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERP29P30040 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ERP29P30040 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERP29P30040 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERP29P30040 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERP29P30040 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERP29P30040 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERP29P30040 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERP29P30040 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERP29P30040 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERP29P30040 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERP29P30040 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ERP29P30040 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERP29P30040 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERP29P30040 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERP29P30040 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERP29P30040 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERP29P30040 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERP29P30040 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERP29P30040 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERP29P30040 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERP29P30040 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERP29P30040 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERP29P30040 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERP29P30040 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERP29P30040 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERP29P30040 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERP29P30040 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERP29P30040 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ERP29P30040 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERP29P30040 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERP29P30040 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ERP29P30040 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERP29P30040 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ERP29P30040 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERP29P30040 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERP29P30040 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERP29P30040 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERP29P30040 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERP29P30040 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERP29P30040 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERP29P30040 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERP29P30040 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ERP29P30040 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERP29P30040 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERP29P30040 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERP29P30040 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ERP29P30040 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERP29P30040 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERP29P30040 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERP29P30040 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERP29P30040 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERP29P30040 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERP29P30040 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERP29P30040 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERP29P30040 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERP29P30040 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERP29P30040 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERP29P30040 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERP29P30040 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERP29P30040 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERP29P30040 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERP29P30040 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERP29P30040 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERP29P30040 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ERP29P30040 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERP29P30040 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERP29P30040 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERP29P30040 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERP29P30040 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERP29P30040 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERP29P30040 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERP29P30040 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERP29P30040 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERP29P30040 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERP29P30040 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERP29P30040 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERP29P30040 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ERP29P30040 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERP29P30040 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERP29P30040 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERP29P30040 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERP29P30040 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERP29P30040 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERP29P30040 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERP29P30040 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERP29P30040 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERP29P30040 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERP29P30040 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERP29P30040 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms