Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREB1P16220 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREB1P16220 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREB1P16220 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREB1P16220 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREB1P16220 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CREB1P16220 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREB1P16220 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREB1P16220 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREB1P16220 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREB1P16220 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREB1P16220 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREB1P16220 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREB1P16220 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREB1P16220 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREB1P16220 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREB1P16220 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREB1P16220 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREB1P16220 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREB1P16220 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREB1P16220 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREB1P16220 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREB1P16220 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREB1P16220 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CREB1P16220 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CREB1P16220 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CREB1P16220 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CREB1P16220 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CREB1P16220 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CREB1P16220 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CREB1P16220 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CREB1P16220 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CREB1P16220 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CREB1P16220 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CREB1P16220 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CREB1P16220 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CREB1P16220 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CREB1P16220 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CREB1P16220 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CREB1P16220 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CREB1P16220 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CREB1P16220 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CREB1P16220 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CREB1P16220 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CREB1P16220 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CREB1P16220 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CREB1P16220 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CREB1P16220 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CREB1P16220 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CREB1P16220 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CREB1P16220 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CREB1P16220 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CREB1P16220 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CREB1P16220 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CREB1P16220 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CREB1P16220 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CREB1P16220 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CREB1P16220 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CREB1P16220 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CREB1P16220 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CREB1P16220 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CREB1P16220 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CREB1P16220 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CREB1P16220 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CREB1P16220 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CREB1P16220 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CREB1P16220 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CREB1P16220 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CREB1P16220 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CREB1P16220 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CREB1P16220 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CREB1P16220 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CREB1P16220 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CREB1P16220 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CREB1P16220 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CREB1P16220 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CREB1P16220 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CREB1P16220 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CREB1P16220 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CREB1P16220 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CREB1P16220 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CREB1P16220 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CREB1P16220 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CREB1P16220 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CREB1P16220 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CREB1P16220 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CREB1P16220 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CREB1P16220 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CREB1P16220 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CREB1P16220 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CREB1P16220 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CREB1P16220 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CREB1P16220 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CREB1P16220 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CREB1P16220 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CREB1P16220 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CREB1P16220 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CREB1P16220 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CREB1P16220 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CREB1P16220 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms