Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAPPC2BP0DI82 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2BP0DI82 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms