Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRCP08575 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRCP08575 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
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