Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPBP07199 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPBP07199 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPBP07199 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPBP07199 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPBP07199 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPBP07199 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPBP07199 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPBP07199 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPBP07199 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPBP07199 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPBP07199 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPBP07199 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPBP07199 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPBP07199 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPBP07199 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPBP07199 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPBP07199 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPBP07199 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPBP07199 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPBP07199 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPBP07199 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPBP07199 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPBP07199 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPBP07199 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPBP07199 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPBP07199 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPBP07199 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPBP07199 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPBP07199 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPBP07199 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPBP07199 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPBP07199 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPBP07199 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPBP07199 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPBP07199 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPBP07199 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPBP07199 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPBP07199 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPBP07199 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPBP07199 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPBP07199 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPBP07199 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPBP07199 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPBP07199 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPBP07199 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPBP07199 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPBP07199 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPBP07199 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPBP07199 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPBP07199 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPBP07199 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPBP07199 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CENPBP07199 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPBP07199 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPBP07199 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPBP07199 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPBP07199 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPBP07199 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPBP07199 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPBP07199 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPBP07199 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPBP07199 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPBP07199 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPBP07199 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPBP07199 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPBP07199 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPBP07199 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPBP07199 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPBP07199 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPBP07199 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPBP07199 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPBP07199 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPBP07199 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPBP07199 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPBP07199 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPBP07199 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPBP07199 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPBP07199 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPBP07199 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPBP07199 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPBP07199 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPBP07199 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPBP07199 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPBP07199 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CENPBP07199 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CENPBP07199 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CENPBP07199 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CENPBP07199 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CENPBP07199 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CENPBP07199 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CENPBP07199 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CENPBP07199 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CENPBP07199 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CENPBP07199 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CENPBP07199 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CENPBP07199 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CENPBP07199 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CENPBP07199 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CENPBP07199 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms