Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SKAP2O75563 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms