Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNSO60931 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNSO60931 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNSO60931 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNSO60931 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNSO60931 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNSO60931 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNSO60931 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNSO60931 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNSO60931 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNSO60931 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNSO60931 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNSO60931 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNSO60931 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNSO60931 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNSO60931 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNSO60931 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNSO60931 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNSO60931 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNSO60931 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNSO60931 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNSO60931 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNSO60931 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNSO60931 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNSO60931 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNSO60931 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNSO60931 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNSO60931 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNSO60931 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNSO60931 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNSO60931 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNSO60931 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNSO60931 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNSO60931 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNSO60931 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNSO60931 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNSO60931 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNSO60931 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNSO60931 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNSO60931 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNSO60931 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNSO60931 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNSO60931 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNSO60931 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNSO60931 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNSO60931 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNSO60931 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNSO60931 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNSO60931 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTNSO60931 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CTNSO60931 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CTNSO60931 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CTNSO60931 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNSO60931 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNSO60931 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNSO60931 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNSO60931 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNSO60931 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNSO60931 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNSO60931 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNSO60931 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNSO60931 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNSO60931 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNSO60931 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNSO60931 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNSO60931 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNSO60931 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNSO60931 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNSO60931 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNSO60931 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNSO60931 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNSO60931 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNSO60931 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNSO60931 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNSO60931 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNSO60931 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNSO60931 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNSO60931 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNSO60931 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTNSO60931 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNSO60931 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNSO60931 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNSO60931 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNSO60931 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNSO60931 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNSO60931 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNSO60931 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNSO60931 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNSO60931 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNSO60931 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNSO60931 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNSO60931 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNSO60931 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNSO60931 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNSO60931 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNSO60931 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNSO60931 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNSO60931 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNSO60931 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTNSO60931 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms