Protein–RNA interactions for Protein: O60613

SELENOF, Selenoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOFO60613 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SELENOFO60613 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms