Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SYNGR3O43761 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms