Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms