Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BHLHE40O14503 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BHLHE40O14503 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms