Protein–RNA interactions for Protein: C9J366

IQCJ-SCHIP1, IQCJ-SCHIP1 readthrough, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQCJ-SCHIP1C9J366 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IQCJ-SCHIP1C9J366 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms