Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVV-2B6SEH9 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-2B6SEH9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms