Protein–RNA interactions for Protein: B1ANY3

FAM220BP, Putative protein FAM220BP, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM220BPB1ANY3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM220BPB1ANY3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM220BPB1ANY3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM220BPB1ANY3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM220BPB1ANY3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM220BPB1ANY3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM220BPB1ANY3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM220BPB1ANY3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM220BPB1ANY3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM220BPB1ANY3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM220BPB1ANY3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM220BPB1ANY3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM220BPB1ANY3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM220BPB1ANY3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM220BPB1ANY3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM220BPB1ANY3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM220BPB1ANY3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM220BPB1ANY3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM220BPB1ANY3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM220BPB1ANY3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM220BPB1ANY3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM220BPB1ANY3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM220BPB1ANY3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM220BPB1ANY3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM220BPB1ANY3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM220BPB1ANY3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM220BPB1ANY3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM220BPB1ANY3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM220BPB1ANY3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM220BPB1ANY3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM220BPB1ANY3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM220BPB1ANY3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM220BPB1ANY3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM220BPB1ANY3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM220BPB1ANY3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM220BPB1ANY3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM220BPB1ANY3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM220BPB1ANY3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM220BPB1ANY3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM220BPB1ANY3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM220BPB1ANY3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM220BPB1ANY3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM220BPB1ANY3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM220BPB1ANY3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM220BPB1ANY3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM220BPB1ANY3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM220BPB1ANY3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM220BPB1ANY3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM220BPB1ANY3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM220BPB1ANY3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM220BPB1ANY3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM220BPB1ANY3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM220BPB1ANY3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM220BPB1ANY3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM220BPB1ANY3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM220BPB1ANY3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM220BPB1ANY3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM220BPB1ANY3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM220BPB1ANY3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM220BPB1ANY3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM220BPB1ANY3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM220BPB1ANY3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM220BPB1ANY3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM220BPB1ANY3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM220BPB1ANY3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM220BPB1ANY3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM220BPB1ANY3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM220BPB1ANY3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM220BPB1ANY3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM220BPB1ANY3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM220BPB1ANY3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM220BPB1ANY3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM220BPB1ANY3 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM220BPB1ANY3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM220BPB1ANY3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM220BPB1ANY3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM220BPB1ANY3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM220BPB1ANY3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM220BPB1ANY3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM220BPB1ANY3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM220BPB1ANY3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM220BPB1ANY3 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM220BPB1ANY3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM220BPB1ANY3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM220BPB1ANY3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM220BPB1ANY3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM220BPB1ANY3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM220BPB1ANY3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM220BPB1ANY3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM220BPB1ANY3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM220BPB1ANY3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM220BPB1ANY3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM220BPB1ANY3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM220BPB1ANY3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM220BPB1ANY3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM220BPB1ANY3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM220BPB1ANY3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM220BPB1ANY3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM220BPB1ANY3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM220BPB1ANY3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms