Protein–RNA interactions for Protein: A6NIR3

AGAP5, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP5A6NIR3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AGAP5A6NIR3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms