Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms