Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRRD1A4D1F6 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms