Protein–RNA interactions for Protein: U3KQV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQV3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U3KQV3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U3KQV3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U3KQV3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
U3KQV3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
U3KQV3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
U3KQV3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
U3KQV3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
U3KQV3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
U3KQV3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
U3KQV3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U3KQV3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U3KQV3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U3KQV3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
U3KQV3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U3KQV3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U3KQV3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
U3KQV3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
U3KQV3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
U3KQV3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
U3KQV3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
U3KQV3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
U3KQV3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
U3KQV3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
U3KQV3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
U3KQV3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
U3KQV3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
U3KQV3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
U3KQV3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
U3KQV3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
U3KQV3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
U3KQV3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
U3KQV3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U3KQV3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U3KQV3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
U3KQV3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U3KQV3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
U3KQV3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
U3KQV3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
U3KQV3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
U3KQV3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U3KQV3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U3KQV3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
U3KQV3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U3KQV3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
U3KQV3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
U3KQV3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U3KQV3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U3KQV3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U3KQV3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
U3KQV3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
U3KQV3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U3KQV3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U3KQV3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U3KQV3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U3KQV3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
U3KQV3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
U3KQV3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
U3KQV3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U3KQV3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
U3KQV3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U3KQV3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
U3KQV3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U3KQV3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U3KQV3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
U3KQV3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U3KQV3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U3KQV3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U3KQV3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
U3KQV3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
U3KQV3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
U3KQV3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
U3KQV3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
U3KQV3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
U3KQV3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
U3KQV3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
U3KQV3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
U3KQV3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U3KQV3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
U3KQV3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
U3KQV3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U3KQV3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
U3KQV3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U3KQV3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U3KQV3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
U3KQV3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U3KQV3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U3KQV3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
U3KQV3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U3KQV3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
U3KQV3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U3KQV3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U3KQV3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
U3KQV3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U3KQV3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U3KQV3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U3KQV3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U3KQV3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U3KQV3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U3KQV3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms