Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6U3

SCIN, Adseverin, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCINQ9Y6U3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCINQ9Y6U3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCINQ9Y6U3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCINQ9Y6U3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCINQ9Y6U3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCINQ9Y6U3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCINQ9Y6U3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCINQ9Y6U3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCINQ9Y6U3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCINQ9Y6U3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCINQ9Y6U3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SCINQ9Y6U3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCINQ9Y6U3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SCINQ9Y6U3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCINQ9Y6U3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCINQ9Y6U3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCINQ9Y6U3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCINQ9Y6U3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCINQ9Y6U3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCINQ9Y6U3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCINQ9Y6U3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCINQ9Y6U3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCINQ9Y6U3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCINQ9Y6U3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCINQ9Y6U3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCINQ9Y6U3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCINQ9Y6U3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCINQ9Y6U3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCINQ9Y6U3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCINQ9Y6U3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCINQ9Y6U3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCINQ9Y6U3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCINQ9Y6U3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCINQ9Y6U3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCINQ9Y6U3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCINQ9Y6U3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCINQ9Y6U3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCINQ9Y6U3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCINQ9Y6U3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCINQ9Y6U3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCINQ9Y6U3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCINQ9Y6U3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCINQ9Y6U3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCINQ9Y6U3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SCINQ9Y6U3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCINQ9Y6U3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCINQ9Y6U3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCINQ9Y6U3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCINQ9Y6U3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCINQ9Y6U3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCINQ9Y6U3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCINQ9Y6U3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCINQ9Y6U3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCINQ9Y6U3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCINQ9Y6U3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCINQ9Y6U3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCINQ9Y6U3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCINQ9Y6U3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCINQ9Y6U3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCINQ9Y6U3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCINQ9Y6U3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCINQ9Y6U3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCINQ9Y6U3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCINQ9Y6U3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCINQ9Y6U3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCINQ9Y6U3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SCINQ9Y6U3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SCINQ9Y6U3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCINQ9Y6U3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCINQ9Y6U3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCINQ9Y6U3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCINQ9Y6U3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCINQ9Y6U3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCINQ9Y6U3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCINQ9Y6U3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCINQ9Y6U3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCINQ9Y6U3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SCINQ9Y6U3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCINQ9Y6U3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCINQ9Y6U3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCINQ9Y6U3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SCINQ9Y6U3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCINQ9Y6U3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCINQ9Y6U3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCINQ9Y6U3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCINQ9Y6U3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCINQ9Y6U3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCINQ9Y6U3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCINQ9Y6U3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCINQ9Y6U3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SCINQ9Y6U3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCINQ9Y6U3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCINQ9Y6U3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCINQ9Y6U3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCINQ9Y6U3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCINQ9Y6U3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCINQ9Y6U3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCINQ9Y6U3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCINQ9Y6U3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCINQ9Y6U3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms