Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y646

CPQ, Carboxypeptidase Q, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPQQ9Y646 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPQQ9Y646 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPQQ9Y646 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CPQQ9Y646 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CPQQ9Y646 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CPQQ9Y646 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPQQ9Y646 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPQQ9Y646 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPQQ9Y646 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPQQ9Y646 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPQQ9Y646 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPQQ9Y646 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPQQ9Y646 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPQQ9Y646 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPQQ9Y646 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPQQ9Y646 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPQQ9Y646 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPQQ9Y646 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPQQ9Y646 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPQQ9Y646 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPQQ9Y646 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPQQ9Y646 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPQQ9Y646 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPQQ9Y646 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPQQ9Y646 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPQQ9Y646 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPQQ9Y646 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CPQQ9Y646 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPQQ9Y646 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPQQ9Y646 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPQQ9Y646 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CPQQ9Y646 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPQQ9Y646 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPQQ9Y646 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CPQQ9Y646 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPQQ9Y646 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPQQ9Y646 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPQQ9Y646 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPQQ9Y646 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPQQ9Y646 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPQQ9Y646 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPQQ9Y646 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPQQ9Y646 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPQQ9Y646 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPQQ9Y646 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPQQ9Y646 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPQQ9Y646 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPQQ9Y646 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CPQQ9Y646 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPQQ9Y646 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPQQ9Y646 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPQQ9Y646 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPQQ9Y646 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPQQ9Y646 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPQQ9Y646 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPQQ9Y646 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPQQ9Y646 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CPQQ9Y646 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CPQQ9Y646 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPQQ9Y646 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPQQ9Y646 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPQQ9Y646 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPQQ9Y646 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPQQ9Y646 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPQQ9Y646 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPQQ9Y646 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPQQ9Y646 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPQQ9Y646 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPQQ9Y646 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPQQ9Y646 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPQQ9Y646 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPQQ9Y646 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CPQQ9Y646 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPQQ9Y646 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPQQ9Y646 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPQQ9Y646 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPQQ9Y646 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPQQ9Y646 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPQQ9Y646 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPQQ9Y646 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CPQQ9Y646 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPQQ9Y646 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPQQ9Y646 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPQQ9Y646 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPQQ9Y646 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPQQ9Y646 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPQQ9Y646 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPQQ9Y646 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPQQ9Y646 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPQQ9Y646 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPQQ9Y646 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPQQ9Y646 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CPQQ9Y646 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPQQ9Y646 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPQQ9Y646 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPQQ9Y646 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPQQ9Y646 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPQQ9Y646 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPQQ9Y646 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CPQQ9Y646 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms