Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y639

NPTN, Neuroplastin, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTNQ9Y639 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPTNQ9Y639 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPTNQ9Y639 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPTNQ9Y639 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPTNQ9Y639 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPTNQ9Y639 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NPTNQ9Y639 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPTNQ9Y639 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPTNQ9Y639 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPTNQ9Y639 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPTNQ9Y639 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NPTNQ9Y639 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPTNQ9Y639 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPTNQ9Y639 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPTNQ9Y639 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NPTNQ9Y639 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPTNQ9Y639 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPTNQ9Y639 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPTNQ9Y639 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPTNQ9Y639 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPTNQ9Y639 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPTNQ9Y639 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPTNQ9Y639 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPTNQ9Y639 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPTNQ9Y639 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPTNQ9Y639 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPTNQ9Y639 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPTNQ9Y639 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPTNQ9Y639 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPTNQ9Y639 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPTNQ9Y639 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPTNQ9Y639 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPTNQ9Y639 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPTNQ9Y639 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPTNQ9Y639 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPTNQ9Y639 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPTNQ9Y639 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPTNQ9Y639 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPTNQ9Y639 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPTNQ9Y639 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPTNQ9Y639 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NPTNQ9Y639 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPTNQ9Y639 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPTNQ9Y639 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPTNQ9Y639 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPTNQ9Y639 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPTNQ9Y639 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPTNQ9Y639 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NPTNQ9Y639 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPTNQ9Y639 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPTNQ9Y639 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NPTNQ9Y639 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NPTNQ9Y639 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPTNQ9Y639 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPTNQ9Y639 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPTNQ9Y639 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPTNQ9Y639 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPTNQ9Y639 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NPTNQ9Y639 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPTNQ9Y639 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPTNQ9Y639 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPTNQ9Y639 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NPTNQ9Y639 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPTNQ9Y639 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NPTNQ9Y639 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPTNQ9Y639 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPTNQ9Y639 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPTNQ9Y639 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPTNQ9Y639 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPTNQ9Y639 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NPTNQ9Y639 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NPTNQ9Y639 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NPTNQ9Y639 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NPTNQ9Y639 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPTNQ9Y639 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPTNQ9Y639 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPTNQ9Y639 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPTNQ9Y639 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPTNQ9Y639 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPTNQ9Y639 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPTNQ9Y639 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPTNQ9Y639 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPTNQ9Y639 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPTNQ9Y639 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPTNQ9Y639 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPTNQ9Y639 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPTNQ9Y639 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPTNQ9Y639 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPTNQ9Y639 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPTNQ9Y639 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPTNQ9Y639 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPTNQ9Y639 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NPTNQ9Y639 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPTNQ9Y639 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPTNQ9Y639 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPTNQ9Y639 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPTNQ9Y639 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPTNQ9Y639 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPTNQ9Y639 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPTNQ9Y639 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms