Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF6Q9Y4K3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF6Q9Y4K3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF6Q9Y4K3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF6Q9Y4K3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF6Q9Y4K3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAF6Q9Y4K3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAF6Q9Y4K3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAF6Q9Y4K3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAF6Q9Y4K3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAF6Q9Y4K3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAF6Q9Y4K3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAF6Q9Y4K3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAF6Q9Y4K3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAF6Q9Y4K3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF6Q9Y4K3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF6Q9Y4K3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF6Q9Y4K3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF6Q9Y4K3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAF6Q9Y4K3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF6Q9Y4K3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF6Q9Y4K3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF6Q9Y4K3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF6Q9Y4K3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF6Q9Y4K3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF6Q9Y4K3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAF6Q9Y4K3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF6Q9Y4K3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF6Q9Y4K3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF6Q9Y4K3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF6Q9Y4K3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAF6Q9Y4K3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF6Q9Y4K3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF6Q9Y4K3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF6Q9Y4K3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF6Q9Y4K3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF6Q9Y4K3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF6Q9Y4K3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAF6Q9Y4K3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF6Q9Y4K3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF6Q9Y4K3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF6Q9Y4K3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF6Q9Y4K3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF6Q9Y4K3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAF6Q9Y4K3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAF6Q9Y4K3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAF6Q9Y4K3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAF6Q9Y4K3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAF6Q9Y4K3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAF6Q9Y4K3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF6Q9Y4K3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF6Q9Y4K3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF6Q9Y4K3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF6Q9Y4K3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF6Q9Y4K3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF6Q9Y4K3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF6Q9Y4K3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF6Q9Y4K3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF6Q9Y4K3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF6Q9Y4K3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAF6Q9Y4K3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF6Q9Y4K3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF6Q9Y4K3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAF6Q9Y4K3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF6Q9Y4K3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF6Q9Y4K3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF6Q9Y4K3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF6Q9Y4K3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF6Q9Y4K3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF6Q9Y4K3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF6Q9Y4K3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAF6Q9Y4K3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF6Q9Y4K3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF6Q9Y4K3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF6Q9Y4K3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAF6Q9Y4K3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF6Q9Y4K3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF6Q9Y4K3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF6Q9Y4K3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF6Q9Y4K3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF6Q9Y4K3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF6Q9Y4K3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF6Q9Y4K3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF6Q9Y4K3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAF6Q9Y4K3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF6Q9Y4K3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF6Q9Y4K3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF6Q9Y4K3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF6Q9Y4K3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF6Q9Y4K3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF6Q9Y4K3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF6Q9Y4K3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAF6Q9Y4K3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF6Q9Y4K3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF6Q9Y4K3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF6Q9Y4K3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF6Q9Y4K3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF6Q9Y4K3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF6Q9Y4K3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAF6Q9Y4K3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms