Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q3

TMED3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED3Q9Y3Q3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMED3Q9Y3Q3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMED3Q9Y3Q3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TMED3Q9Y3Q3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMED3Q9Y3Q3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMED3Q9Y3Q3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMED3Q9Y3Q3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMED3Q9Y3Q3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMED3Q9Y3Q3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TMED3Q9Y3Q3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMED3Q9Y3Q3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TMED3Q9Y3Q3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMED3Q9Y3Q3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMED3Q9Y3Q3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMED3Q9Y3Q3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMED3Q9Y3Q3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMED3Q9Y3Q3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TMED3Q9Y3Q3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMED3Q9Y3Q3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TMED3Q9Y3Q3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMED3Q9Y3Q3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMED3Q9Y3Q3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMED3Q9Y3Q3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMED3Q9Y3Q3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMED3Q9Y3Q3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMED3Q9Y3Q3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMED3Q9Y3Q3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TMED3Q9Y3Q3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMED3Q9Y3Q3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMED3Q9Y3Q3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMED3Q9Y3Q3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMED3Q9Y3Q3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMED3Q9Y3Q3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMED3Q9Y3Q3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMED3Q9Y3Q3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMED3Q9Y3Q3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMED3Q9Y3Q3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMED3Q9Y3Q3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMED3Q9Y3Q3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMED3Q9Y3Q3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMED3Q9Y3Q3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMED3Q9Y3Q3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMED3Q9Y3Q3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMED3Q9Y3Q3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMED3Q9Y3Q3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TMED3Q9Y3Q3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMED3Q9Y3Q3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMED3Q9Y3Q3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMED3Q9Y3Q3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMED3Q9Y3Q3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMED3Q9Y3Q3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMED3Q9Y3Q3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMED3Q9Y3Q3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TMED3Q9Y3Q3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMED3Q9Y3Q3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMED3Q9Y3Q3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMED3Q9Y3Q3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMED3Q9Y3Q3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMED3Q9Y3Q3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMED3Q9Y3Q3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMED3Q9Y3Q3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMED3Q9Y3Q3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMED3Q9Y3Q3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMED3Q9Y3Q3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMED3Q9Y3Q3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMED3Q9Y3Q3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMED3Q9Y3Q3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMED3Q9Y3Q3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMED3Q9Y3Q3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMED3Q9Y3Q3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMED3Q9Y3Q3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMED3Q9Y3Q3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMED3Q9Y3Q3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMED3Q9Y3Q3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMED3Q9Y3Q3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMED3Q9Y3Q3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMED3Q9Y3Q3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMED3Q9Y3Q3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMED3Q9Y3Q3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMED3Q9Y3Q3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMED3Q9Y3Q3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMED3Q9Y3Q3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMED3Q9Y3Q3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMED3Q9Y3Q3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMED3Q9Y3Q3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMED3Q9Y3Q3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMED3Q9Y3Q3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMED3Q9Y3Q3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMED3Q9Y3Q3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMED3Q9Y3Q3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMED3Q9Y3Q3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMED3Q9Y3Q3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMED3Q9Y3Q3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMED3Q9Y3Q3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMED3Q9Y3Q3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMED3Q9Y3Q3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMED3Q9Y3Q3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMED3Q9Y3Q3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMED3Q9Y3Q3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMED3Q9Y3Q3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms