Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
UBE2J1Q9Y385 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE2J1Q9Y385 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE2J1Q9Y385 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE2J1Q9Y385 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE2J1Q9Y385 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE2J1Q9Y385 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE2J1Q9Y385 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE2J1Q9Y385 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE2J1Q9Y385 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE2J1Q9Y385 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UBE2J1Q9Y385 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2J1Q9Y385 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2J1Q9Y385 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2J1Q9Y385 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2J1Q9Y385 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2J1Q9Y385 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2J1Q9Y385 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2J1Q9Y385 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2J1Q9Y385 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UBE2J1Q9Y385 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE2J1Q9Y385 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE2J1Q9Y385 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE2J1Q9Y385 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UBE2J1Q9Y385 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE2J1Q9Y385 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE2J1Q9Y385 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE2J1Q9Y385 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE2J1Q9Y385 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE2J1Q9Y385 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE2J1Q9Y385 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE2J1Q9Y385 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UBE2J1Q9Y385 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2J1Q9Y385 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2J1Q9Y385 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2J1Q9Y385 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2J1Q9Y385 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UBE2J1Q9Y385 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE2J1Q9Y385 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE2J1Q9Y385 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE2J1Q9Y385 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE2J1Q9Y385 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE2J1Q9Y385 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE2J1Q9Y385 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE2J1Q9Y385 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
UBE2J1Q9Y385 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE2J1Q9Y385 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE2J1Q9Y385 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE2J1Q9Y385 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE2J1Q9Y385 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE2J1Q9Y385 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE2J1Q9Y385 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE2J1Q9Y385 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
UBE2J1Q9Y385 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2J1Q9Y385 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2J1Q9Y385 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2J1Q9Y385 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2J1Q9Y385 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2J1Q9Y385 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
UBE2J1Q9Y385 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2J1Q9Y385 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2J1Q9Y385 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2J1Q9Y385 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2J1Q9Y385 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2J1Q9Y385 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2J1Q9Y385 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2J1Q9Y385 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2J1Q9Y385 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2J1Q9Y385 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2J1Q9Y385 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2J1Q9Y385 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2J1Q9Y385 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2J1Q9Y385 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2J1Q9Y385 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
UBE2J1Q9Y385 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE2J1Q9Y385 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE2J1Q9Y385 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE2J1Q9Y385 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE2J1Q9Y385 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE2J1Q9Y385 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE2J1Q9Y385 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
UBE2J1Q9Y385 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE2J1Q9Y385 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE2J1Q9Y385 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE2J1Q9Y385 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE2J1Q9Y385 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE2J1Q9Y385 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE2J1Q9Y385 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE2J1Q9Y385 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE2J1Q9Y385 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
UBE2J1Q9Y385 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE2J1Q9Y385 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
UBE2J1Q9Y385 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBE2J1Q9Y385 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBE2J1Q9Y385 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
UBE2J1Q9Y385 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
UBE2J1Q9Y385 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBE2J1Q9Y385 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBE2J1Q9Y385 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
UBE2J1Q9Y385 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms