Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CAB39Q9Y376 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAB39Q9Y376 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAB39Q9Y376 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAB39Q9Y376 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAB39Q9Y376 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAB39Q9Y376 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CAB39Q9Y376 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAB39Q9Y376 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAB39Q9Y376 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAB39Q9Y376 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CAB39Q9Y376 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAB39Q9Y376 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAB39Q9Y376 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAB39Q9Y376 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAB39Q9Y376 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CAB39Q9Y376 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAB39Q9Y376 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAB39Q9Y376 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAB39Q9Y376 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAB39Q9Y376 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAB39Q9Y376 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAB39Q9Y376 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAB39Q9Y376 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAB39Q9Y376 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAB39Q9Y376 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAB39Q9Y376 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAB39Q9Y376 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAB39Q9Y376 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAB39Q9Y376 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAB39Q9Y376 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAB39Q9Y376 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAB39Q9Y376 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAB39Q9Y376 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAB39Q9Y376 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAB39Q9Y376 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAB39Q9Y376 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAB39Q9Y376 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAB39Q9Y376 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAB39Q9Y376 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAB39Q9Y376 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAB39Q9Y376 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAB39Q9Y376 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAB39Q9Y376 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CAB39Q9Y376 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAB39Q9Y376 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAB39Q9Y376 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAB39Q9Y376 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAB39Q9Y376 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAB39Q9Y376 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAB39Q9Y376 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAB39Q9Y376 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAB39Q9Y376 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAB39Q9Y376 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAB39Q9Y376 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAB39Q9Y376 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAB39Q9Y376 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAB39Q9Y376 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAB39Q9Y376 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CAB39Q9Y376 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms