Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2R0

COA3, Cytochrome c oxidase assembly factor 3 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COA3Q9Y2R0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COA3Q9Y2R0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COA3Q9Y2R0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COA3Q9Y2R0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COA3Q9Y2R0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COA3Q9Y2R0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COA3Q9Y2R0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COA3Q9Y2R0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COA3Q9Y2R0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COA3Q9Y2R0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COA3Q9Y2R0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COA3Q9Y2R0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COA3Q9Y2R0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COA3Q9Y2R0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COA3Q9Y2R0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COA3Q9Y2R0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
COA3Q9Y2R0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COA3Q9Y2R0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COA3Q9Y2R0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COA3Q9Y2R0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
COA3Q9Y2R0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COA3Q9Y2R0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COA3Q9Y2R0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COA3Q9Y2R0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COA3Q9Y2R0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COA3Q9Y2R0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COA3Q9Y2R0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COA3Q9Y2R0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COA3Q9Y2R0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COA3Q9Y2R0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COA3Q9Y2R0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COA3Q9Y2R0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COA3Q9Y2R0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COA3Q9Y2R0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COA3Q9Y2R0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COA3Q9Y2R0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COA3Q9Y2R0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COA3Q9Y2R0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COA3Q9Y2R0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COA3Q9Y2R0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COA3Q9Y2R0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COA3Q9Y2R0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
COA3Q9Y2R0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COA3Q9Y2R0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COA3Q9Y2R0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COA3Q9Y2R0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COA3Q9Y2R0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COA3Q9Y2R0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COA3Q9Y2R0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COA3Q9Y2R0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COA3Q9Y2R0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
COA3Q9Y2R0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COA3Q9Y2R0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COA3Q9Y2R0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COA3Q9Y2R0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COA3Q9Y2R0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COA3Q9Y2R0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COA3Q9Y2R0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COA3Q9Y2R0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COA3Q9Y2R0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COA3Q9Y2R0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COA3Q9Y2R0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COA3Q9Y2R0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COA3Q9Y2R0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COA3Q9Y2R0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COA3Q9Y2R0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COA3Q9Y2R0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COA3Q9Y2R0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COA3Q9Y2R0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COA3Q9Y2R0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COA3Q9Y2R0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COA3Q9Y2R0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COA3Q9Y2R0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COA3Q9Y2R0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COA3Q9Y2R0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COA3Q9Y2R0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COA3Q9Y2R0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COA3Q9Y2R0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COA3Q9Y2R0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COA3Q9Y2R0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
COA3Q9Y2R0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COA3Q9Y2R0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COA3Q9Y2R0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COA3Q9Y2R0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COA3Q9Y2R0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COA3Q9Y2R0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COA3Q9Y2R0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COA3Q9Y2R0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COA3Q9Y2R0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COA3Q9Y2R0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COA3Q9Y2R0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COA3Q9Y2R0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COA3Q9Y2R0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COA3Q9Y2R0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COA3Q9Y2R0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COA3Q9Y2R0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COA3Q9Y2R0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COA3Q9Y2R0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COA3Q9Y2R0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COA3Q9Y2R0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms