Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQC9

CLCA2, Calcium-activated chloride channel regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA2Q9UQC9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLCA2Q9UQC9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLCA2Q9UQC9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLCA2Q9UQC9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLCA2Q9UQC9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCA2Q9UQC9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCA2Q9UQC9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCA2Q9UQC9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCA2Q9UQC9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCA2Q9UQC9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCA2Q9UQC9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCA2Q9UQC9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCA2Q9UQC9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCA2Q9UQC9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCA2Q9UQC9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCA2Q9UQC9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCA2Q9UQC9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCA2Q9UQC9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCA2Q9UQC9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCA2Q9UQC9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCA2Q9UQC9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCA2Q9UQC9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCA2Q9UQC9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCA2Q9UQC9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCA2Q9UQC9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCA2Q9UQC9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCA2Q9UQC9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCA2Q9UQC9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLCA2Q9UQC9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLCA2Q9UQC9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLCA2Q9UQC9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLCA2Q9UQC9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLCA2Q9UQC9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLCA2Q9UQC9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CLCA2Q9UQC9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLCA2Q9UQC9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLCA2Q9UQC9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLCA2Q9UQC9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLCA2Q9UQC9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLCA2Q9UQC9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CLCA2Q9UQC9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLCA2Q9UQC9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLCA2Q9UQC9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLCA2Q9UQC9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLCA2Q9UQC9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLCA2Q9UQC9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLCA2Q9UQC9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLCA2Q9UQC9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLCA2Q9UQC9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLCA2Q9UQC9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLCA2Q9UQC9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLCA2Q9UQC9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLCA2Q9UQC9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLCA2Q9UQC9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CLCA2Q9UQC9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLCA2Q9UQC9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CLCA2Q9UQC9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLCA2Q9UQC9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLCA2Q9UQC9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLCA2Q9UQC9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLCA2Q9UQC9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLCA2Q9UQC9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CLCA2Q9UQC9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLCA2Q9UQC9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLCA2Q9UQC9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CLCA2Q9UQC9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLCA2Q9UQC9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLCA2Q9UQC9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLCA2Q9UQC9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLCA2Q9UQC9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLCA2Q9UQC9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLCA2Q9UQC9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLCA2Q9UQC9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLCA2Q9UQC9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CLCA2Q9UQC9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLCA2Q9UQC9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLCA2Q9UQC9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLCA2Q9UQC9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLCA2Q9UQC9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLCA2Q9UQC9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLCA2Q9UQC9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLCA2Q9UQC9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CLCA2Q9UQC9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CLCA2Q9UQC9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLCA2Q9UQC9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLCA2Q9UQC9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLCA2Q9UQC9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLCA2Q9UQC9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLCA2Q9UQC9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLCA2Q9UQC9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLCA2Q9UQC9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLCA2Q9UQC9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLCA2Q9UQC9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLCA2Q9UQC9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLCA2Q9UQC9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLCA2Q9UQC9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLCA2Q9UQC9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLCA2Q9UQC9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLCA2Q9UQC9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLCA2Q9UQC9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms