Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ53

MGAT4B, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase B, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT4BQ9UQ53 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MGAT4BQ9UQ53 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MGAT4BQ9UQ53 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MGAT4BQ9UQ53 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MGAT4BQ9UQ53 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MGAT4BQ9UQ53 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MGAT4BQ9UQ53 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MGAT4BQ9UQ53 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MGAT4BQ9UQ53 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MGAT4BQ9UQ53 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MGAT4BQ9UQ53 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MGAT4BQ9UQ53 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MGAT4BQ9UQ53 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MGAT4BQ9UQ53 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MGAT4BQ9UQ53 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
MGAT4BQ9UQ53 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MGAT4BQ9UQ53 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MGAT4BQ9UQ53 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MGAT4BQ9UQ53 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MGAT4BQ9UQ53 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MGAT4BQ9UQ53 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MGAT4BQ9UQ53 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MGAT4BQ9UQ53 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MGAT4BQ9UQ53 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MGAT4BQ9UQ53 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MGAT4BQ9UQ53 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MGAT4BQ9UQ53 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MGAT4BQ9UQ53 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MGAT4BQ9UQ53 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MGAT4BQ9UQ53 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MGAT4BQ9UQ53 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MGAT4BQ9UQ53 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MGAT4BQ9UQ53 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MGAT4BQ9UQ53 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MGAT4BQ9UQ53 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MGAT4BQ9UQ53 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MGAT4BQ9UQ53 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MGAT4BQ9UQ53 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MGAT4BQ9UQ53 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MGAT4BQ9UQ53 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MGAT4BQ9UQ53 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MGAT4BQ9UQ53 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MGAT4BQ9UQ53 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MGAT4BQ9UQ53 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MGAT4BQ9UQ53 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MGAT4BQ9UQ53 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MGAT4BQ9UQ53 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MGAT4BQ9UQ53 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MGAT4BQ9UQ53 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MGAT4BQ9UQ53 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MGAT4BQ9UQ53 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MGAT4BQ9UQ53 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MGAT4BQ9UQ53 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MGAT4BQ9UQ53 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MGAT4BQ9UQ53 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MGAT4BQ9UQ53 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MGAT4BQ9UQ53 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MGAT4BQ9UQ53 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MGAT4BQ9UQ53 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MGAT4BQ9UQ53 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MGAT4BQ9UQ53 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MGAT4BQ9UQ53 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MGAT4BQ9UQ53 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MGAT4BQ9UQ53 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MGAT4BQ9UQ53 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MGAT4BQ9UQ53 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MGAT4BQ9UQ53 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MGAT4BQ9UQ53 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MGAT4BQ9UQ53 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MGAT4BQ9UQ53 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MGAT4BQ9UQ53 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MGAT4BQ9UQ53 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MGAT4BQ9UQ53 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MGAT4BQ9UQ53 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MGAT4BQ9UQ53 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MGAT4BQ9UQ53 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MGAT4BQ9UQ53 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MGAT4BQ9UQ53 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MGAT4BQ9UQ53 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MGAT4BQ9UQ53 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MGAT4BQ9UQ53 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MGAT4BQ9UQ53 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MGAT4BQ9UQ53 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MGAT4BQ9UQ53 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MGAT4BQ9UQ53 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MGAT4BQ9UQ53 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MGAT4BQ9UQ53 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MGAT4BQ9UQ53 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MGAT4BQ9UQ53 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MGAT4BQ9UQ53 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MGAT4BQ9UQ53 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MGAT4BQ9UQ53 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MGAT4BQ9UQ53 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MGAT4BQ9UQ53 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MGAT4BQ9UQ53 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MGAT4BQ9UQ53 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MGAT4BQ9UQ53 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MGAT4BQ9UQ53 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MGAT4BQ9UQ53 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MGAT4BQ9UQ53 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms