Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY8

MAPRE3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3Q9UPY8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAPRE3Q9UPY8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAPRE3Q9UPY8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAPRE3Q9UPY8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAPRE3Q9UPY8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAPRE3Q9UPY8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAPRE3Q9UPY8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MAPRE3Q9UPY8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAPRE3Q9UPY8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAPRE3Q9UPY8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAPRE3Q9UPY8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAPRE3Q9UPY8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAPRE3Q9UPY8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MAPRE3Q9UPY8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MAPRE3Q9UPY8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MAPRE3Q9UPY8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAPRE3Q9UPY8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MAPRE3Q9UPY8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAPRE3Q9UPY8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAPRE3Q9UPY8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MAPRE3Q9UPY8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAPRE3Q9UPY8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MAPRE3Q9UPY8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAPRE3Q9UPY8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAPRE3Q9UPY8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAPRE3Q9UPY8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAPRE3Q9UPY8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAPRE3Q9UPY8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MAPRE3Q9UPY8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
MAPRE3Q9UPY8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MAPRE3Q9UPY8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAPRE3Q9UPY8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAPRE3Q9UPY8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAPRE3Q9UPY8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAPRE3Q9UPY8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAPRE3Q9UPY8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAPRE3Q9UPY8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAPRE3Q9UPY8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAPRE3Q9UPY8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAPRE3Q9UPY8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAPRE3Q9UPY8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MAPRE3Q9UPY8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAPRE3Q9UPY8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAPRE3Q9UPY8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAPRE3Q9UPY8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAPRE3Q9UPY8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAPRE3Q9UPY8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAPRE3Q9UPY8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAPRE3Q9UPY8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAPRE3Q9UPY8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAPRE3Q9UPY8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAPRE3Q9UPY8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAPRE3Q9UPY8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAPRE3Q9UPY8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAPRE3Q9UPY8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAPRE3Q9UPY8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAPRE3Q9UPY8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAPRE3Q9UPY8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAPRE3Q9UPY8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAPRE3Q9UPY8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAPRE3Q9UPY8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAPRE3Q9UPY8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAPRE3Q9UPY8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MAPRE3Q9UPY8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MAPRE3Q9UPY8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MAPRE3Q9UPY8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MAPRE3Q9UPY8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MAPRE3Q9UPY8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MAPRE3Q9UPY8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAPRE3Q9UPY8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAPRE3Q9UPY8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAPRE3Q9UPY8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAPRE3Q9UPY8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAPRE3Q9UPY8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAPRE3Q9UPY8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAPRE3Q9UPY8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MAPRE3Q9UPY8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAPRE3Q9UPY8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAPRE3Q9UPY8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAPRE3Q9UPY8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAPRE3Q9UPY8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAPRE3Q9UPY8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MAPRE3Q9UPY8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAPRE3Q9UPY8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAPRE3Q9UPY8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAPRE3Q9UPY8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAPRE3Q9UPY8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAPRE3Q9UPY8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAPRE3Q9UPY8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAPRE3Q9UPY8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAPRE3Q9UPY8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAPRE3Q9UPY8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAPRE3Q9UPY8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAPRE3Q9UPY8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAPRE3Q9UPY8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAPRE3Q9UPY8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAPRE3Q9UPY8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAPRE3Q9UPY8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MAPRE3Q9UPY8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAPRE3Q9UPY8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 501.2 ms