Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNN4

GTF2A1L, TFIIA-alpha and beta-like factor, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1LQ9UNN4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2A1LQ9UNN4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2A1LQ9UNN4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2A1LQ9UNN4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2A1LQ9UNN4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2A1LQ9UNN4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2A1LQ9UNN4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2A1LQ9UNN4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2A1LQ9UNN4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2A1LQ9UNN4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2A1LQ9UNN4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2A1LQ9UNN4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2A1LQ9UNN4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2A1LQ9UNN4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2A1LQ9UNN4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A1LQ9UNN4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A1LQ9UNN4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A1LQ9UNN4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A1LQ9UNN4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2A1LQ9UNN4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GTF2A1LQ9UNN4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF2A1LQ9UNN4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2A1LQ9UNN4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2A1LQ9UNN4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2A1LQ9UNN4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2A1LQ9UNN4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2A1LQ9UNN4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2A1LQ9UNN4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2A1LQ9UNN4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2A1LQ9UNN4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2A1LQ9UNN4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2A1LQ9UNN4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2A1LQ9UNN4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2A1LQ9UNN4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2A1LQ9UNN4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2A1LQ9UNN4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2A1LQ9UNN4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2A1LQ9UNN4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2A1LQ9UNN4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2A1LQ9UNN4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2A1LQ9UNN4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2A1LQ9UNN4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2A1LQ9UNN4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms