Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX6Q9UNH7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX6Q9UNH7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX6Q9UNH7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX6Q9UNH7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX6Q9UNH7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX6Q9UNH7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX6Q9UNH7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX6Q9UNH7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX6Q9UNH7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX6Q9UNH7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX6Q9UNH7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX6Q9UNH7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX6Q9UNH7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX6Q9UNH7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX6Q9UNH7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX6Q9UNH7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX6Q9UNH7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX6Q9UNH7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX6Q9UNH7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX6Q9UNH7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX6Q9UNH7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX6Q9UNH7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX6Q9UNH7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX6Q9UNH7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX6Q9UNH7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX6Q9UNH7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX6Q9UNH7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX6Q9UNH7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX6Q9UNH7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX6Q9UNH7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX6Q9UNH7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX6Q9UNH7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX6Q9UNH7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX6Q9UNH7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX6Q9UNH7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX6Q9UNH7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX6Q9UNH7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX6Q9UNH7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX6Q9UNH7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNX6Q9UNH7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX6Q9UNH7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX6Q9UNH7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX6Q9UNH7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX6Q9UNH7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX6Q9UNH7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX6Q9UNH7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX6Q9UNH7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX6Q9UNH7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX6Q9UNH7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX6Q9UNH7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX6Q9UNH7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX6Q9UNH7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX6Q9UNH7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX6Q9UNH7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX6Q9UNH7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX6Q9UNH7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX6Q9UNH7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX6Q9UNH7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX6Q9UNH7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX6Q9UNH7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX6Q9UNH7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX6Q9UNH7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX6Q9UNH7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX6Q9UNH7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX6Q9UNH7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX6Q9UNH7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX6Q9UNH7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX6Q9UNH7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX6Q9UNH7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX6Q9UNH7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX6Q9UNH7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX6Q9UNH7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX6Q9UNH7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX6Q9UNH7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX6Q9UNH7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX6Q9UNH7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX6Q9UNH7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX6Q9UNH7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX6Q9UNH7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX6Q9UNH7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX6Q9UNH7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX6Q9UNH7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX6Q9UNH7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX6Q9UNH7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX6Q9UNH7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX6Q9UNH7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX6Q9UNH7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX6Q9UNH7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX6Q9UNH7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX6Q9UNH7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX6Q9UNH7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX6Q9UNH7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX6Q9UNH7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX6Q9UNH7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX6Q9UNH7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX6Q9UNH7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX6Q9UNH7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX6Q9UNH7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX6Q9UNH7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms