Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX7Q9UNH6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX7Q9UNH6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX7Q9UNH6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX7Q9UNH6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX7Q9UNH6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX7Q9UNH6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX7Q9UNH6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX7Q9UNH6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX7Q9UNH6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX7Q9UNH6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX7Q9UNH6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SNX7Q9UNH6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SNX7Q9UNH6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX7Q9UNH6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX7Q9UNH6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX7Q9UNH6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX7Q9UNH6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX7Q9UNH6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX7Q9UNH6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX7Q9UNH6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX7Q9UNH6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX7Q9UNH6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX7Q9UNH6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX7Q9UNH6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX7Q9UNH6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX7Q9UNH6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX7Q9UNH6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX7Q9UNH6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX7Q9UNH6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX7Q9UNH6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX7Q9UNH6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX7Q9UNH6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX7Q9UNH6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX7Q9UNH6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX7Q9UNH6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX7Q9UNH6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX7Q9UNH6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX7Q9UNH6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX7Q9UNH6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX7Q9UNH6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX7Q9UNH6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX7Q9UNH6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX7Q9UNH6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX7Q9UNH6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX7Q9UNH6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX7Q9UNH6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX7Q9UNH6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX7Q9UNH6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX7Q9UNH6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX7Q9UNH6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX7Q9UNH6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX7Q9UNH6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX7Q9UNH6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX7Q9UNH6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX7Q9UNH6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX7Q9UNH6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX7Q9UNH6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX7Q9UNH6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX7Q9UNH6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX7Q9UNH6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX7Q9UNH6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX7Q9UNH6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX7Q9UNH6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX7Q9UNH6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX7Q9UNH6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX7Q9UNH6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX7Q9UNH6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX7Q9UNH6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX7Q9UNH6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX7Q9UNH6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX7Q9UNH6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX7Q9UNH6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX7Q9UNH6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX7Q9UNH6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX7Q9UNH6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX7Q9UNH6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX7Q9UNH6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX7Q9UNH6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX7Q9UNH6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX7Q9UNH6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX7Q9UNH6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX7Q9UNH6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX7Q9UNH6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX7Q9UNH6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX7Q9UNH6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX7Q9UNH6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX7Q9UNH6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX7Q9UNH6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX7Q9UNH6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX7Q9UNH6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX7Q9UNH6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX7Q9UNH6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX7Q9UNH6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX7Q9UNH6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX7Q9UNH6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX7Q9UNH6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX7Q9UNH6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX7Q9UNH6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX7Q9UNH6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms