Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
L1RE1Q9UN81 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
L1RE1Q9UN81 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
L1RE1Q9UN81 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
L1RE1Q9UN81 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
L1RE1Q9UN81 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
L1RE1Q9UN81 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
L1RE1Q9UN81 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
L1RE1Q9UN81 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
L1RE1Q9UN81 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
L1RE1Q9UN81 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
L1RE1Q9UN81 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
L1RE1Q9UN81 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
L1RE1Q9UN81 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
L1RE1Q9UN81 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
L1RE1Q9UN81 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
L1RE1Q9UN81 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
L1RE1Q9UN81 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
L1RE1Q9UN81 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
L1RE1Q9UN81 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
L1RE1Q9UN81 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
L1RE1Q9UN81 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
L1RE1Q9UN81 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
L1RE1Q9UN81 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
L1RE1Q9UN81 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
L1RE1Q9UN81 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
L1RE1Q9UN81 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
L1RE1Q9UN81 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
L1RE1Q9UN81 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
L1RE1Q9UN81 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
L1RE1Q9UN81 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
L1RE1Q9UN81 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
L1RE1Q9UN81 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
L1RE1Q9UN81 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
L1RE1Q9UN81 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
L1RE1Q9UN81 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
L1RE1Q9UN81 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
L1RE1Q9UN81 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
L1RE1Q9UN81 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
L1RE1Q9UN81 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
L1RE1Q9UN81 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
L1RE1Q9UN81 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
L1RE1Q9UN81 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
L1RE1Q9UN81 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
L1RE1Q9UN81 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
L1RE1Q9UN81 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
L1RE1Q9UN81 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
L1RE1Q9UN81 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
L1RE1Q9UN81 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
L1RE1Q9UN81 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
L1RE1Q9UN81 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
L1RE1Q9UN81 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
L1RE1Q9UN81 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
L1RE1Q9UN81 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
L1RE1Q9UN81 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
L1RE1Q9UN81 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
L1RE1Q9UN81 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
L1RE1Q9UN81 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
L1RE1Q9UN81 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
L1RE1Q9UN81 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
L1RE1Q9UN81 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
L1RE1Q9UN81 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
L1RE1Q9UN81 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
L1RE1Q9UN81 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
L1RE1Q9UN81 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
L1RE1Q9UN81 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
L1RE1Q9UN81 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
L1RE1Q9UN81 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
L1RE1Q9UN81 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
L1RE1Q9UN81 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
L1RE1Q9UN81 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
L1RE1Q9UN81 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
L1RE1Q9UN81 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
L1RE1Q9UN81 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
L1RE1Q9UN81 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
L1RE1Q9UN81 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
L1RE1Q9UN81 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
L1RE1Q9UN81 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
L1RE1Q9UN81 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
L1RE1Q9UN81 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
L1RE1Q9UN81 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
L1RE1Q9UN81 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
L1RE1Q9UN81 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
L1RE1Q9UN81 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
L1RE1Q9UN81 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
L1RE1Q9UN81 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
L1RE1Q9UN81 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
L1RE1Q9UN81 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
L1RE1Q9UN81 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
L1RE1Q9UN81 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
L1RE1Q9UN81 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
L1RE1Q9UN81 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
L1RE1Q9UN81 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
L1RE1Q9UN81 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
L1RE1Q9UN81 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
L1RE1Q9UN81 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
L1RE1Q9UN81 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
L1RE1Q9UN81 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
L1RE1Q9UN81 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
L1RE1Q9UN81 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms