Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMCC3Q9ULS5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMCC3Q9ULS5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMCC3Q9ULS5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMCC3Q9ULS5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMCC3Q9ULS5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMCC3Q9ULS5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMCC3Q9ULS5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMCC3Q9ULS5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMCC3Q9ULS5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCC3Q9ULS5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCC3Q9ULS5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMCC3Q9ULS5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCC3Q9ULS5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMCC3Q9ULS5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCC3Q9ULS5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCC3Q9ULS5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCC3Q9ULS5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCC3Q9ULS5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMCC3Q9ULS5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCC3Q9ULS5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCC3Q9ULS5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCC3Q9ULS5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCC3Q9ULS5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMCC3Q9ULS5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCC3Q9ULS5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCC3Q9ULS5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCC3Q9ULS5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCC3Q9ULS5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCC3Q9ULS5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCC3Q9ULS5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCC3Q9ULS5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCC3Q9ULS5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCC3Q9ULS5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCC3Q9ULS5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCC3Q9ULS5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMCC3Q9ULS5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMCC3Q9ULS5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMCC3Q9ULS5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMCC3Q9ULS5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMCC3Q9ULS5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMCC3Q9ULS5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMCC3Q9ULS5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMCC3Q9ULS5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCC3Q9ULS5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCC3Q9ULS5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCC3Q9ULS5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCC3Q9ULS5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCC3Q9ULS5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCC3Q9ULS5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCC3Q9ULS5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMCC3Q9ULS5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCC3Q9ULS5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCC3Q9ULS5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCC3Q9ULS5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCC3Q9ULS5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCC3Q9ULS5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCC3Q9ULS5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCC3Q9ULS5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCC3Q9ULS5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMCC3Q9ULS5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCC3Q9ULS5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCC3Q9ULS5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCC3Q9ULS5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCC3Q9ULS5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMCC3Q9ULS5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCC3Q9ULS5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCC3Q9ULS5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCC3Q9ULS5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCC3Q9ULS5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMCC3Q9ULS5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCC3Q9ULS5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCC3Q9ULS5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCC3Q9ULS5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMCC3Q9ULS5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCC3Q9ULS5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCC3Q9ULS5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMCC3Q9ULS5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCC3Q9ULS5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCC3Q9ULS5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCC3Q9ULS5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCC3Q9ULS5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMCC3Q9ULS5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMCC3Q9ULS5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCC3Q9ULS5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCC3Q9ULS5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCC3Q9ULS5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCC3Q9ULS5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCC3Q9ULS5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCC3Q9ULS5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCC3Q9ULS5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCC3Q9ULS5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCC3Q9ULS5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMCC3Q9ULS5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCC3Q9ULS5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCC3Q9ULS5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCC3Q9ULS5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCC3Q9ULS5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCC3Q9ULS5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMCC3Q9ULS5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms