Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL46

PSME2, Proteasome activator complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME2Q9UL46 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSME2Q9UL46 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSME2Q9UL46 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSME2Q9UL46 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSME2Q9UL46 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSME2Q9UL46 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSME2Q9UL46 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSME2Q9UL46 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSME2Q9UL46 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSME2Q9UL46 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSME2Q9UL46 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSME2Q9UL46 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME2Q9UL46 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME2Q9UL46 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME2Q9UL46 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSME2Q9UL46 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSME2Q9UL46 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSME2Q9UL46 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSME2Q9UL46 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSME2Q9UL46 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSME2Q9UL46 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSME2Q9UL46 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSME2Q9UL46 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSME2Q9UL46 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSME2Q9UL46 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSME2Q9UL46 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSME2Q9UL46 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSME2Q9UL46 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSME2Q9UL46 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSME2Q9UL46 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSME2Q9UL46 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSME2Q9UL46 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PSME2Q9UL46 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSME2Q9UL46 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSME2Q9UL46 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSME2Q9UL46 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PSME2Q9UL46 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSME2Q9UL46 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSME2Q9UL46 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSME2Q9UL46 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PSME2Q9UL46 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSME2Q9UL46 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSME2Q9UL46 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSME2Q9UL46 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSME2Q9UL46 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSME2Q9UL46 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSME2Q9UL46 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSME2Q9UL46 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSME2Q9UL46 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSME2Q9UL46 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSME2Q9UL46 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PSME2Q9UL46 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSME2Q9UL46 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSME2Q9UL46 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSME2Q9UL46 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSME2Q9UL46 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSME2Q9UL46 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSME2Q9UL46 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSME2Q9UL46 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSME2Q9UL46 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSME2Q9UL46 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSME2Q9UL46 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSME2Q9UL46 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSME2Q9UL46 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSME2Q9UL46 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSME2Q9UL46 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSME2Q9UL46 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSME2Q9UL46 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSME2Q9UL46 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSME2Q9UL46 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSME2Q9UL46 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSME2Q9UL46 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSME2Q9UL46 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSME2Q9UL46 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PSME2Q9UL46 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSME2Q9UL46 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSME2Q9UL46 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSME2Q9UL46 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSME2Q9UL46 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSME2Q9UL46 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSME2Q9UL46 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSME2Q9UL46 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSME2Q9UL46 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSME2Q9UL46 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSME2Q9UL46 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME2Q9UL46 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME2Q9UL46 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME2Q9UL46 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME2Q9UL46 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME2Q9UL46 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME2Q9UL46 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME2Q9UL46 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME2Q9UL46 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSME2Q9UL46 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSME2Q9UL46 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSME2Q9UL46 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSME2Q9UL46 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSME2Q9UL46 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PSME2Q9UL46 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSME2Q9UL46 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms